منتخب الأثر فی الامام الثانی عشر(ع) (سه جلد). مع الخطیب فی خطوطه العریضة.
صوت الحقّ ودعوة الصدق. لمحات فی الکتاب و الحدیث و المذهب (سه جلد).
بیان الاُصول (سه جلد). أمان الاُمّة من الضلال والاختلاف.
العقیدة بالمهدیة. جلاء البصر لمن یتولّی الائمة الاثنی عشر.
القرآن مصون عن التحریف. رسالة قیمة حول عصمة الأنبیاء والأئمّة.
عنوان صحیفة المؤمن. سبط المصطفی.
ارث الزوجة. التعزیر؛ أحکامه و ملحقاته.
الاحکام الشرعیة ثابتة لا تتغیر. مع الشیخ جاد الحق فی إرث العصبة (مسألة التعصیب).
إیران تسمع فتجیب. رسالة فی حکم نکول المدّعی علیه عن الیمین.
حدیث افتراق المسلمین علی ثلاث وسبعین فرقة. من لهذا العالم؟
رسالة فی تفسیر آیه التطهیر. رسالة فی ضرورة وجود الحکومة أو ولایة الفقهاء فی عصر الغیبة.
بحث حول الإستقسام بالأزلام (مشروعیة الاستخارة). بین العلمین الشیخ الصدوق والشیخ المفید.
رسالة القرعة (التداعی فی مال من دون بینة ولا ید). النقود اللطیفة علی الکتاب المسمّی بالأخبار الدخیلة. رسالة فی البداء.
إلی هدی کتاب الله. فقه الخمس.
فقه الحجّ (چهار جلد). البکاء علی الإمام الحسین.
تفسیر آیة الإنذار. هدایة العباد (دو جلد).
جامع الأحکام (دو جلد). ولایت تکوینی و ولایت تشریعی.
پرتوی از عظمت امام حسین. شهید آگاه.
الهیات در نهج‌البلاغه. رسالة فی معاملات مستحدثه.
نیایش در عرفات. راه اصلاح یا امر به معروف و نهی از منکر.
سیر حوزه‌های علمی شیعه. نوید امن و امان.
پاسخ به ده پرسش. سفرنامه حج.
عالی‌ترین مکتب تربیت و اخلاق یا ماه مبارک رمضان. اصالت مهدویت.
تجلّی توحید در نظام امامت. پیرامون معرفت امام.
عقیده نجات‌بخش. به‌سوی دولت کریمه.
ندای اسلام از اروپا. به‌سوی آفریدگار.
انتظار، عامل مقاومت و حرکت. فروغ ولایت در دعای ندبه.
وابستگی جهان به امام زمان. معرفت حجّت خدا.
در آرزوی وصال. زندگانی بوداسف.
اعتبار قصد قربت در وقف. تفسیر آیه فطرت.
زندگانی جابر بن حیان. پیرامون روز تاریخی غدیر.
مقدّمه‌ای بر ترجمه کتاب «مقتضب الأثر». امامت و مهدویت.
حول دیات ظریف ابن‌ناصح. شرح حدیث عرض دین.
رمضان در تاریخ (حوادث تاریخی). نگرشی بر فلسفه و عرفان.
معارف دین (سه جلد). باورداشت مهدویت.
استفتائات پزشکی. استفتائات حجّ (مشتمل بر هزار مسأله).
حاشیه بر عروة الوثقی. رساله توضیح المسائل.
مناسک حجّ. احکام نوجوانان.
مناسک عمره مفرده. حدیث بیداری (مجموعه پیام‌ها).
صراط مستقیم. فخر دوران.
ارمغان مشهد.
زن در پرتو اسلام.
روح بلند آیت الله صافی گلپایگانی به ملکوت اعلی پیوست
دفتر آیت‌الله العظمی صافی گلپایگانی هم در این خصوص اطلاعیه ای صادر کرد که به شرح زیر است:
بسم الله الرحمن الرحیم
الذین تتوفیهم الملائکه طیبین یقولون سلام علیکم ادخلوا الجنه بما کنتم تعملون.
ساعاتی قبل قلب تپنده مرجعی بیدار و مدافع غیور حریم اهل بیت عصمت و طهارت، علیهم السلام، و زبان گویای دفاع از حق واحکام الهی و خادم دلباخته آستان ملائک پاسبان حضرت ولی الله الاعظم، ارواح العالمین له الفداء، زعیم حوزه‌های علمیه، حضرت آیت‌الله العظمی صافی گلپایگانی، قدس سره الشریف، از حرکت باز ایستاد و روح بلند و بی قرارش که مشتاق لقای پروردگار بود، کالبد تن را شکست و به ملکوت اعلی پیوست.
کارنامه پرافتخار این مرجع عالیقدر، مشحون از نُصح و خیرخواهی برای کیان اسلام و تشیّع و دلسوزی برای همه بندگان خدا بود.
ضمن عرض تسلیت این ضایعه جبران ناپذیر به پیشگاه مقدس مولا و محبوبش، حضرت بقيت الله الاعظم، عجل الله تعالی فرجه الشریف و حوزه‌های مبارکه علمیه و مردم شریف ایران و دوستداران مرجعیت در همه نقاط جهان، به اطلاع می‌رساند مراسم تشییع و تدفین پیکر مطهر ایشان، متعاقبا اعلام خواهد گردید.
